El objetivo de la UNAN es de formar profesionales y técnicos integrales desde y con una concepción científica y humanista del mundo, capaces de interpretar los fenómenos sociales y naturales con un sentido crítico, reflexivo y propósito, para que contribuyan al desarrollo social, por medio de un modelo educativo centrado en las personas; un modelo de investigación científica integrador de paradigmas universales; un mejoramiento humano y profesional permanente derivado del grado y posgrado desde una concepción de la educación para la vida; programas de proyección y extensión social, que promuevan la identidad cultural de los y las nicaragüenses; todo ello en un marco de cooperación genuina, equidad, compromiso y justicia social y en armonía con el medio ambiente.
La Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua, UNAN-Managua ha experimentado cambios significativos en los últimos quince años, que han cambiado no sólo su aspecto físico, sino también muchos conceptos que se creían inmutables. En efecto, funciona con nueve facultades: Ciencias Médicas, Educación e Idiomas, Humanidades y Ciencias Jurídicas, Ciencias Económicas, Ciencias e Ingeniería, Regional Multidisciplinaria en Estelí, Regional Multidisciplinaria en Carazo, Regional Multidisciplinaria en Chontales y Regional Multidisciplinaria en Matagalpa; el Instituto Politécnico de la Salud , con sede en la ciudad de Managua; cuenta además, con seis Centros de Investigación: Centro de Investigación y Recursos Acuáticos (CIRA), Centro de Investigación Geocientíficas (CIGEO), Centros de Investigaciones y Estudio de la Salud (CIES), Centro de Investigaciones Socio Educativas (CISE), Centro de Investigaciones Económicas y Tecnológicas (CINET), Instituto Nicaragüense de Investigaciones Económicas y Sociales (INIES), también cuenta con un Laboratorio Especializado de Física de Radiaciones y Metrología.
La coexistencia de Facultades y el Instituto Politécnico de la Salud, instancias donde predomina la docencia, hace que la complejidad de sus actividades difiera a causa de la heterogeneidad estructural.
